Termometar bazalne temperature koristi se za mjerenje tjelesne temperature osobe odmah nakon jutarnjeg buđenja. U poređenju sa dnevnom tjelesnom temperaturom, na bazalnu tjelesnu temperaturu manje utiču faktori okoline kao što su vježbanje ili jedenje. Ovo je korisno za otkrivanje suptilnih dnevnih promjena tjelesne temperature, kao što su tokom ovulacije ili promjene u funkciji štitne žlijezde.
Stakleni termometri za groznicu imaju minimalnu skalu od 0,2 stepena F (0,1 stepen), dok bazalni termometri zahtevaju tačnost od najmanje 0,1 stepen F (0,05 stepeni). Stoga se stakleni bazalni termometri prodaju odvojeno od običnih staklenih termometara za groznicu. Međutim, svi elektronski termometri imaju tačnost od najmanje 0,1 stepen F (0,05 stepeni) i stoga se mogu koristiti kao bazalni termometri. Neki digitalni termometri su posebno označeni kao 'bazalni termometri' i imaju posebne karakteristike, kao što su veliki ekran, dodatne memorijske funkcije ili zvučno navođenje za ispravno postavljanje.
